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Sp-dCas9 CRISPR酶

貨號 32102-01/32102-03 售價(jià)(元) 1500/9000
規(guī)格 100 pmoL/1000 pmoL CAS號
  • 產(chǎn)品簡介
  • 相關(guān)產(chǎn)品

產(chǎn)品信息

 貨號

產(chǎn)品名稱

規(guī)格

價(jià)格

32102-01

Sp-dCas9

100 pmoL

1500

32102-03

Sp-dCas9

1,000 pmoL

9000

產(chǎn)品簡介

SpCas9 來源于 S. pyogenes 菌株,是依賴于 crRNA 和 tracrRNA(或連接后形成的 sgRNA)引導(dǎo)的 DNA內(nèi)切核酸酶,在靶標(biāo)雙鏈 DNA 存在 PAM(NGG)的情況下,特異地切割靶標(biāo)雙鏈 DNA,使 DNA 雙鏈斷裂并生成平末端。PAM 對于 SpCas9 的識別和切割都是必需的,其切割位點(diǎn)位于目標(biāo)序列(target sequence)內(nèi),離 PAM 區(qū) 3 個(gè)堿基。SpCas9 酶的 HNH 和 RuvC 結(jié)構(gòu)域分別負(fù)責(zé)切割靶標(biāo)雙鏈 DNA 中與 sgRNA 配對和非配對的鏈。本產(chǎn)品中,SpCas9 的 H840 和 D10 都被突變?yōu)?A,從而使其 HNH 和 RuvC 功能域失活,獲得了 Sp-dCas9 酶。因此,Sp-dCas9 只有結(jié)合靶標(biāo) DNA 的活性,而沒有切割靶標(biāo) DNA 的活性。

產(chǎn)品組分

組分

32102-01 (100 pmol)

32102-03 (1,000 pmol)

Sp-dCas9 Nuclease (10 μM)a

100 pmol

1,000 pmol

10× TOLO Buffer 3

1 mL

1 mL

a. Sp-dCas9 Nuclease 濃度為 10 μM,即 10 pmol/μL,100 pmol 規(guī)格的總體積為 10 μL,1,000 pmol 規(guī)格的總體積為 100 μL; 

保存條件

-20℃儲存;≤ 0℃運(yùn)輸。

實(shí)驗(yàn)流程

1. Sp-dCas9 與靶標(biāo) DNA 結(jié)合實(shí)驗(yàn)

組分

體積

終濃度

10 × TOLO Buffer 3

2 μL

1 ×

10 μM Sp-dCas9 Nuclease

1.5 μL

750 nM

10 μM sgRNA

1.5 μL

750 nM

1 μM Substrate DNA

3 μL

150 nM

Nuclease-free water

Up to 20 μL

 

37℃反應(yīng) 30 min,可通過非變性核酸電泳對實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行檢測。

實(shí)驗(yàn)結(jié)果

為了驗(yàn)證 Sp-dCas9 與 target DNA 的結(jié)合,我們通過 5′端帶 FAM 基團(tuán)的引物在全長 59 bp 的 targetdsDNA 末端加上 FAM 標(biāo)記。在 20 μL 反應(yīng)體系中加入 2 μL的 10 × TOLO Buffer 3, 1.5 μL 的 10 μM Sp-dCas9Nuclease, 1.5 μL 的 10 μM sgRNA, 和 3 μL 的 1 μM target dsDNA-FAM, 然后將結(jié)合反應(yīng)體系在 37℃靜置孵育 30 min,用 2%的瓊脂糖凝膠低溫電泳 100 V,60 min 后,在化學(xué)發(fā)光成像分析儀(GE ImageQuantLAS4000)上用熒光通道檢測樣本條帶。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,Sp-dCas9 + sgRNA + target dsDNA-FAM 泳道電泳跑膠遷移速率較慢,說明 Sp-dCas9 在 sgRNA 的引導(dǎo)下特異地識別并結(jié)合了 target dsDNA。此外,還可以用非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳(Native-PAGE)對 Sp-dCas9 與 target DNA 的結(jié)合進(jìn)行檢測。

 

 

 

注意事項(xiàng)

1. 為防止 RNase 污染,請保持實(shí)驗(yàn)區(qū)干凈整潔,操作時(shí)需穿戴干凈的手套、口罩,實(shí)驗(yàn)所用槍頭、離心管等耗材均為 RNase-free。

2. 因反應(yīng)需添加 RNA(sgRNA 或者 crRNA:tracrRNA),整個(gè)體系,包括 Sp-dCas9 酶都必須不含任何其它核酸酶活性。本產(chǎn)品經(jīng)過嚴(yán)格質(zhì)控,無任何其它核酸酶污染。

3. 反應(yīng)結(jié)束后,可以采用非變性聚丙烯酰胺(或瓊脂糖)凝膠電泳的方式來檢測 Sp-dCas9 是否結(jié)合靶標(biāo)雙鏈 DNA。電泳緩沖液體系可使用 DEPC 處理以消除 RNase 的影響;同時(shí),應(yīng)保持低溫下電泳,相關(guān)要求可參考 RNA EMSA 體系。

4. Sp-dCas9 酶對熱敏感,容易失活,應(yīng)全程冰上配置反應(yīng)體系,使用后立即置于-20℃保存。

5. 本產(chǎn)品僅供科研使用。若進(jìn)行商業(yè)用途,需聯(lián)系專利持有方獲取相關(guān)的專利授權(quán)。

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